System Start-Stop jest zaprojektowany tak, aby działał tylko wtedy, gdy akumulator jest odpowiednio naładowany i w dobrym stanie. Jeśli poziom naładowania spadnie poniżej określonego progu, system automatycznie się dezaktywuje, aby nie ryzykować problemów z ponownym uruchomieniem silnika. Oprócz stanu akumulatora, na działanie systemu wpływają także inne czynniki, takie jak temperatura silnika, warunki pogodowe, zapotrzebowanie na prąd przez inne systemy (np. klimatyzację), zapięcie pasów czy otwarte drzwi. W przypadku zużytego lub słabego akumulatora system Start-Stop może być całkowicie nieaktywny do czasu wymiany lub doładowania akumulatora.