Bezpośredni związek między niesprawnym alternatorem a uszkodzeniem skrzyni biegów wydaje się mało prawdopodobny, jednak w nowoczesnych samochodach z rozbudowaną elektroniką istnieje kilka scenariuszy, w których awaria alternatora może pośrednio wpłynąć na pracę skrzyni biegów. Przede wszystkim, alternator odpowiada za dostarczanie prądu do wszystkich systemów elektrycznych pojazdu, w tym do sterowników skrzyni biegów, czujników położenia, elektrozaworów i modułów sterujących. W przypadku spadku napięcia lub braku ładowania (np. z powodu uszkodzenia alternatora), komputer skrzyni biegów może przejść w tryb awaryjny, ograniczyć dostępne biegi, zablokować zmianę przełożeń lub całkowicie unieruchomić pojazd. Długotrwała jazda z niedoładowanym akumulatorem prowadzi do spadków napięcia, które mogą powodować błędy w komunikacji między modułami, nieprawidłową pracę elektrozaworów i czujników, a w skrajnych przypadkach uszkodzenie sterownika skrzyni biegów. W skrzyniach automatycznych, gdzie zmiana biegów zależy od sygnałów elektrycznych, brak stabilnego napięcia może prowadzić do szarpania, opóźnień w zmianie przełożeń, a nawet trwałego uszkodzenia mechanizmu. Warto pamiętać, że nowoczesne skrzynie biegów są bardzo wrażliwe na jakość zasilania – wszelkie nieprawidłowości w pracy alternatora powinny być natychmiast diagnozowane i usuwane, by uniknąć kosztownych napraw.