System Start-Stop w samochodach terenowych działa na podobnej zasadzie jak w autach miejskich, jednak jego implementacja i algorytmy działania są dostosowane do specyfiki jazdy w trudnych warunkach. W terenie, gdzie często występują nierówności, błoto, piasek czy strome podjazdy, Start-Stop musi uwzględniać dodatkowe czynniki, by nie zakłócać płynności jazdy i nie narażać kierowcy na niebezpieczeństwo. Przede wszystkim, system analizuje położenie pojazdu, kąt nachylenia, pracę napędów oraz wybrane tryby jazdy terenowej. W przypadku wykrycia jazdy w trybie 4×4, włączonej blokady mechanizmu różnicowego lub aktywnego asystenta zjazdu, Start-Stop jest automatycznie dezaktywowany lub jego działanie zostaje ograniczone. Dzięki temu silnik nie wyłączy się w momencie, gdy potrzebna jest natychmiastowa reakcja na zmieniające się warunki podłoża. Dodatkowo, system bierze pod uwagę pracę wspomagania kierownicy, klimatyzacji, a także zapotrzebowanie na energię elektryczną – w terenie często korzysta się z dodatkowego oświetlenia, wyciągarki czy kompresora, co wymaga ciągłego ładowania akumulatora przez alternator. Start-Stop w autach terenowych jest wyposażony w czujniki położenia pojazdu i analizuje, czy auto nie znajduje się na stromym zboczu – w takich sytuacjach wyłączenie silnika mogłoby utrudnić ponowne ruszenie lub grozić stoczeniem się pojazdu. W praktyce, kierowca auta terenowego ma często możliwość ręcznego wyłączenia systemu Start-Stop za pomocą przycisku na desce rozdzielczej, co jest zalecane podczas jazdy w trudnym terenie. Nowoczesne systemy Start-Stop są coraz bardziej inteligentne i potrafią samodzielnie rozpoznawać warunki terenowe, minimalizując ryzyko niepożądanego wyłączenia silnika i zapewniając pełną kontrolę nad pojazdem w każdej sytuacji.
