Immobiliser i ECU (sterownik silnika) to dwa kluczowe elementy systemu zabezpieczeń i zarządzania pracą pojazdu, które są ze sobą ściśle powiązane. Bezpiecznik ECU odpowiada za zasilanie sterownika silnika, a tym samym za całą komunikację pomiędzy immobiliserem a komputerem pojazdu. Po wyjęciu bezpiecznika ECU, sterownik silnika przestaje być zasilany – nie odbiera sygnałów z immobilisera, nie przeprowadza autoryzacji klucza i nie pozwala na uruchomienie silnika. W takiej sytuacji immobiliser formalnie pozostaje aktywny, ale nie może wykonać swojej funkcji, ponieważ nie ma z kim się komunikować – system jest „martwy”, a pojazd nie reaguje na próby rozruchu. Po ponownym włożeniu bezpiecznika i przywróceniu zasilania, immobiliser i ECU wznawiają komunikację – w większości nowoczesnych aut dane o autoryzowanych kluczach są przechowywane w nieulotnej pamięci, więc system powinien działać prawidłowo. W niektórych starszych modelach lub przy dłuższym odłączeniu zasilania może być konieczna ponowna synchronizacja kluczyka lub wprowadzenie kodu PIN. Wyjęcie bezpiecznika ECU jest jedną z metod awaryjnego unieruchomienia pojazdu, stosowaną np. przez służby ratunkowe, ale nie jest zalecane jako sposób zabezpieczenia auta na co dzień. Regularna kontrola stanu bezpieczników i unikanie ich nieautoryzowanego wyjmowania to podstawa bezproblemowej eksploatacji systemu zdalnego dostępu i immobilisera.
