Sterownik automatycznej klapy bagażnika jest newralgicznym elementem całego systemu — zarządza zasilaniem, nadzoruje pracę siłowników oraz integruje czujniki i dodatkowe zabezpieczenia. Przeciążenie, czyli nagłe zwiększenie oporu ruchu (np. przez zablokowanie klapy, przymarznięcie lub próbę siłowego zamknięcia ręcznego w trybie automatycznym), może prowadzić do poważnych konsekwencji. Elektroniczne układy zabezpieczają się zwykle poprzez bezpieczniki lub funkcję ograniczenia prądu — jeśli jednak mechanizm jest niesprawny, a użytkownik bagatelizuje niepokojące objawy (dziwne dźwięki, stuknięcia, brak reakcji na polecenia), długotrwałe przeciążenie może doprowadzić do uszkodzenia lub nawet spalenia sterownika. Szczególną ostrożność trzeba zachować w niskich temperaturach, gdy siłowniki mogą działać z większym oporem. Objawami uszkodzenia mogą być migające kontrolki, brak reakcji klapy, pojawienie się komunikatów na wyświetlaczu auta lub przepalony bezpiecznik. W takiej sytuacji konieczna jest natychmiastowa diagnostyka w serwisie — przeciążony sterownik często wymaga wymiany i ponownego programowania, a naprawa zignorowanych usterek może być znacznie bardziej kosztowna niż szybka interwencja techniczna.