Wymiana klapy bagażnika z funkcją automatycznego otwierania nie ogranicza się wyłącznie do zamontowania nowego elementu mechanicznego czy siłownika. W zdecydowanej większości nowszych pojazdów konieczne jest zaprogramowanie klapy po wymianie — wynika to z potrzeby skalibrowania położeń krańcowych, ustawienia siły zamykania, przypisania nowego elementu do sterownika oraz integracji z systemem pojazdu (np. alarmem, centralnym zamkiem, elektryką szyb). Proces programowania odbywa się najczęściej przy użyciu fabrycznego komputera diagnostycznego lub specjalnego urządzenia serwisowego — samodzielne przeprowadzenie tej operacji bez odpowiedniego sprzętu i wiedzy jest praktycznie niemożliwe. Objawami nieprawidłowego programowania mogą być niepełne otwarcie lub domknięcie klapy, błędy wyświetlane na desce rozdzielczej, brak reakcji na pilota lub kolizje klapy z karoserią. Nowoczesne systemy posiadają procedury „uczenia” — określają, w jakim zakresie może poruszać się nowa klapa oraz jak powinna reagować na przeszkody. Po każdej wymianie klapy, siłownika lub sterownika zalecana jest wizyta w autoryzowanym serwisie, gdzie wykonuje się pełną procedurę kodowania i adaptacji mechanizmu. Tylko wtedy system pracuje bezpiecznie i niezawodnie, a użytkownik korzysta ze wszystkich udogodnień oferowanych przez nowoczesne otwieranie bagażnika.
