Układy start-stop oraz immobiliser to dwa niezależne systemy, które jednak muszą ze sobą współpracować, aby zapewnić zarówno bezpieczeństwo, jak i komfort użytkowania pojazdu. Immobiliser odpowiada za autoryzację rozruchu silnika – blokuje zapłon i wtrysk paliwa, jeśli nie rozpozna prawidłowego klucza lub transpondera. Układ start-stop automatycznie wyłącza i uruchamia silnik podczas krótkotrwałych postojów (np. na światłach), aby ograniczyć zużycie paliwa i emisję spalin. Współpraca obu systemów polega na tym, że immobiliser nie dezaktywuje się po pierwszym uruchomieniu silnika, lecz pozostaje w trybie monitorowania. Gdy układ start-stop wyłącza silnik na skrzyżowaniu, immobiliser nie blokuje ponownego rozruchu – komputer pokładowy pamięta, że klucz został już autoryzowany podczas pierwszego uruchomienia. Dopiero po wyjęciu kluczyka lub oddaleniu się pilota (w systemach keyless) immobiliser ponownie przechodzi w tryb blokady. Dzięki temu użytkownik nie musi każdorazowo autoryzować klucza przy każdym cyklu start-stop, a jednocześnie zachowane jest pełne bezpieczeństwo pojazdu. W przypadku awarii immobilisera lub braku rozpoznania klucza, układ start-stop nie zadziała, a silnik pozostanie wyłączony do czasu ponownej autoryzacji. Warto regularnie sprawdzać stan kluczyka i systemu zabezpieczeń, aby uniknąć problemów z działaniem obu układów.
