Wielu kierowców zastanawia się, czy można czasowo wyłączyć system Start-Stop bez konieczności ingerencji w elektronikę pojazdu czy stosowania nieautoryzowanych modyfikacji. W zdecydowanej większości nowoczesnych samochodów przewidziano taką możliwość – producenci wyposażyli auta w dedykowany przycisk lub opcję w menu komputera pokładowego, pozwalającą na dezaktywację systemu Start-Stop na czas danej podróży. Po naciśnięciu przycisku z symbolem „A” otoczonym strzałką lub wybraniu odpowiedniej opcji na ekranie, Start-Stop zostaje wyłączony do momentu ponownego uruchomienia silnika. Po każdym restarcie pojazdu system automatycznie wraca do ustawień fabrycznych i znów jest aktywny – wynika to z przepisów homologacyjnych dotyczących emisji spalin i zużycia paliwa. Wyłączenie Start-Stop jest przydatne zwłaszcza w sytuacjach, gdy przewidujemy częste zatrzymywanie się na krótkie okresy (np. w korkach, przy manewrowaniu na parkingu, podczas holowania przyczepy czy jazdy w trudnych warunkach pogodowych). W niektórych modelach samochodów istnieje możliwość trwałego wyłączenia Start-Stop poprzez zmianę ustawień w komputerze serwisowym, jednak taka modyfikacja może skutkować utratą gwarancji lub problemami podczas przeglądu technicznego. W codziennej eksploatacji wystarczy jednak użyć fabrycznego przycisku – to najprostszy i najbezpieczniejszy sposób na czasowe wyłączenie systemu, bez ryzyka uszkodzenia elektroniki czy utraty funkcjonalności innych układów pojazdu.