Szyby elektryczne w nowoczesnych pojazdach są coraz częściej sterowane przez zaawansowane moduły komfortu lub oddzielne sterowniki szyb. Programowanie szyb z poziomu komputera diagnostycznego jest możliwe i często niezbędne, zwłaszcza po wymianie mechanizmów, przewodów czy samej szyby. Dzięki interfejsom diagnostycznym, takim jak OBD-II połączonym z oprogramowaniem dedykowanym do konkretnej marki pojazdu (np. VCDS w Volkswagenach czy ISTA w BMW), można przeprowadzić m.in. kalibrację krańcowych położeń szyb, aktywację lub dezaktywację funkcji takich jak automatyczne domykanie czy zabezpieczenie antyzaciskowe. Programowanie obejmuje także reset błędów pojawiających się w przypadku niewłaściwej pracy silniczka czy przycisków oraz konfigurację indywidualnych ustawień związanych z komfortem użytkowania. Dzięki temu po wymianie szyb lub mechanizmów nie jest już konieczne ręczne ustawianie długości ruchu czy wielokrotne testowanie – moduł sam rozpoznaje nowe granice, minimalizując ryzyko uszkodzeń i poprawiając czas reakcji. W niektórych samochodach pojawia się także możliwość dopasowania priorytetów sterowania – na przykład programowe „przypisanie” klawiszy do konkretnych szyb lub zmiana kierunków ruchu. W praktyce jednak, zakres i sposób programowania różnią się znacząco między producentami, a niektóre starsze pojazdy nie dysponują takimi funkcjami i wymagają manualnego ustawienia. Programowanie jest też kluczowe podczas montażu dodatkowych funkcji, np. dołożenia automatycznego domykania szyb z pilota, które w standardzie danego modelu mogły być wyłączone.
