Układ SCR, choć zaprojektowany jako system bezobsługowy, w praktyce może wymagać okresowego czyszczenia lub płukania, zwłaszcza w przypadku awarii, stosowania niskiej jakości AdBlue lub eksploatacji w trudnych warunkach. Najczęstszym powodem konieczności czyszczenia są osady z krystalizującego mocznika, które mogą blokować przewody, wtryskiwacz lub powierzchnię katalizatora. Objawami zanieczyszczenia są błędy systemu, spadek skuteczności redukcji NOx, zwiększone zużycie AdBlue i pojawianie się komunikatów o awarii SCR. Czyszczenie układu polega na przepłukaniu przewodów i wtryskiwacza specjalistycznymi preparatami, a w przypadku poważniejszych zanieczyszczeń – demontażu i profesjonalnym czyszczeniu katalizatora. Płukanie układu powinno być wykonywane w serwisie, przy użyciu odpowiednich narzędzi i środków chemicznych, by nie uszkodzić delikatnych elementów SCR. Regularne stosowanie certyfikowanego AdBlue, dbanie o czystość wlewu i szybka reakcja na pierwsze objawy awarii minimalizują ryzyko konieczności czyszczenia układu. W praktyce, przy prawidłowej eksploatacji, płukanie SCR jest rzadko potrzebne, ale w razie problemów z wydajnością systemu lub powtarzających się błędów warto rozważyć ten zabieg, by uniknąć kosztownej wymiany katalizatora.
