Układ ładowania w samochodzie jest zabezpieczony przez kilka typów bezpieczników, których zadaniem jest ochrona alternatora, akumulatora i całej instalacji elektrycznej przed skutkami zwarć, przeciążeń lub awarii. Najważniejsze są bezpieczniki wysokoprądowe, zwykle umieszczone w skrzynce bezpieczników w komorze silnika – są to tzw. bezpieczniki główne, o wartościach 60–110 A, które chronią przewody prowadzące od alternatora do akumulatora. Alternator posiada często własny bezpiecznik, zabezpieczający jego wyjście przed zwarciem lub przeciążeniem. W niektórych modelach samochodów oddzielny bezpiecznik chroni przewód zasilający instalację pojazdu (oprócz rozrusznika). Dodatkowo, w układzie ładowania mogą występować bezpieczniki niskoprądowe (10–30 A), zabezpieczające regulator napięcia, przekaźniki oraz obwody sterujące. Nowoczesne pojazdy wyposażone są również w przekaźniki i wyłączniki nadprądowe, które automatycznie odcinają zasilanie w przypadku wykrycia nieprawidłowości. Regularna kontrola stanu bezpieczników i ich wymiana na elementy o odpowiednich parametrach to podstawa bezpiecznego działania układu ładowania. Warto pamiętać, że uszkodzony lub źle dobrany bezpiecznik może prowadzić do poważnych awarii, a nawet pożaru instalacji elektrycznej.
