Zimą filtr paliwa jest szczególnie narażony na zalanie wodą i parafiną, które wytrącają się z oleju napędowego w niskich temperaturach. Objawy zalanego filtra paliwa są bardzo charakterystyczne, zwłaszcza w dieslach, i mogą prowadzić do poważnych problemów z rozruchem oraz pracą silnika. Najczęściej pierwszym sygnałem jest utrudnione uruchamianie silnika, szczególnie rano lub po dłuższym postoju. Silnik może długo „kręcić”, a rozrusznik szybko się rozładowuje. Kolejnym objawem jest nierówna praca silnika na biegu jałowym – obroty falują, silnik szarpie, a nawet gaśnie na postoju. W trakcie jazdy zauważalne są spadki mocy, brak reakcji na gaz, a przy próbie przyspieszenia auto może szarpać lub całkowicie się dławić. W skrajnych przypadkach silnik gaśnie podczas jazdy lub nie daje się w ogóle uruchomić. Dodatkowo, zużycie paliwa może wzrosnąć, a z wydechu wydobywa się nietypowy, często oleisty dym o nieprzyjemnym zapachu. W dieslach zimą typowym problemem jest wytrącanie się parafiny, która krystalizuje się i blokuje przepływ paliwa przez filtr. Woda obecna w filtrze może zamarzać, całkowicie blokując przepływ i unieruchamiając pojazd. W nowoczesnych autach pojawia się kontrolka check engine lub ostrzeżenie o problemie z układem paliwowym. Aby uniknąć tych problemów, zaleca się regularną wymianę filtra paliwa przed zimą, stosowanie dodatków usuwających wodę z paliwa oraz tankowanie na sprawdzonych stacjach. W autach z separatorem wody warto regularnie opróżniać odstojnik. Ignorowanie objawów zalanego filtra może prowadzić do uszkodzenia pompy paliwa i wtryskiwaczy, co generuje bardzo wysokie koszty naprawy.
