Ochrona niemowląt przed komarami wymaga szczególnej ostrożności, ponieważ ich skóra jest delikatna i wrażliwa na działanie chemikaliów. Najbezpieczniejsze są fizyczne metody ochrony: moskitiery na łóżeczko, wózek i okna, lekkie ubrania zakrywające ciało, unikanie spacerów w miejscach i porach największej aktywności komarów (wieczory, okolice wody). W przypadku konieczności użycia środków odstraszających należy wybierać preparaty przeznaczone dla niemowląt – najlepiej na bazie naturalnych olejków (cytrynowy, lawendowy, eukaliptusowy), bez dodatku DEET, icaridyny czy permetryny. Preparaty te stosuje się wyłącznie na ubrania, nie bezpośrednio na skórę dziecka. Nie zaleca się używania elektrycznych odstraszaczy, aerozoli czy spirali w pomieszczeniach, gdzie przebywają niemowlęta. W razie ukąszenia można zastosować łagodne żele łagodzące na bazie aloesu lub pantenolu. Przed użyciem jakiegokolwiek środka należy skonsultować się z pediatrą.
