Odporność odgrywa kluczową rolę w powodzeniu przeszczepu narządu. Układ immunologiczny biorcy rozpoznaje przeszczepiony narząd jako obcy i może go odrzucić. Aby temu zapobiec, stosuje się leki immunosupresyjne, które tłumią odpowiedź immunologiczną, ale jednocześnie zwiększają podatność na infekcje i nowotwory. Równowaga między zapobieganiem odrzutowi a ochroną przed infekcjami to największe wyzwanie transplantologii. Skuteczność terapii zależy od indywidualnego dopasowania leków, monitorowania odporności i ścisłej współpracy pacjenta z zespołem medycznym.