Leki na zgagę (inhibitory pompy protonowej, antagoniści receptora H2, leki zobojętniające) są powszechnie stosowane w leczeniu refluksu i nadkwasoty. Choć skuteczne, ich długotrwałe stosowanie może wiązać się z ryzykiem poważnych powikłań: niedoboru witaminy B12, magnezu, wapnia (zwiększone ryzyko złamań), infekcji przewodu pokarmowego (Clostridioides difficile, Salmonella), zapalenia nerek, zaburzeń wchłaniania leków. Niektóre badania sugerują związek między przewlekłym stosowaniem inhibitorów pompy protonowej a zwiększonym ryzykiem demencji i chorób sercowo-naczyniowych. Leki na zgagę powinny być stosowane zgodnie z zaleceniami lekarza, w najniższej skutecznej dawce i przez możliwie najkrótszy czas. W przypadku przewlekłych objawów konieczna jest diagnostyka i leczenie przyczyny zgagi, a nie tylko jej objawów.