Jelita mają ogromną zdolność do regeneracji, co jest kluczowe dla zdrowia całego organizmu. Proces naprawy rozpoczyna się od usunięcia czynnika uszkadzającego (np. infekcji, toksyn, leków), następnie następuje odbudowa błony śluzowej, namnażanie komórek nabłonka i przywracanie prawidłowej mikroflory. Wspomaganie regeneracji to odpowiednia dieta bogata w błonnik, probiotyki, prebiotyki, aminokwasy (glutamina), kwasy tłuszczowe omega-3, antyoksydanty (witamina C, E, cynk, selen). Ważne jest nawodnienie, unikanie alkoholu, przetworzonej żywności, nadmiaru cukru i tłuszczów trans. Regenerację wspomagają także regularna aktywność fizyczna, redukcja stresu i odpowiednia ilość snu. W przypadku przewlekłych dolegliwości jelitowych konieczna jest diagnostyka i leczenie choroby podstawowej (np. celiakia, nieswoiste zapalenia jelit, SIBO).
