Diagnostyka alergii opiera się na szczegółowym wywiadzie lekarskim i serii badań laboratoryjnych. Najczęściej wykonuje się testy skórne punktowe (prick tests), które polegają na naniesieniu na skórę niewielkiej ilości alergenu i obserwacji reakcji. Wykonuje się także oznaczenie swoistych przeciwciał IgE we krwi (panel alergenów), testy prowokacyjne (np. donosowe, wziewne, pokarmowe), testy płatkowe (przy alergiach kontaktowych) oraz spirometrię (przy podejrzeniu astmy). W niektórych przypadkach lekarz zleca badania dodatkowe – morfologię, poziom eozynofilów, CRP, badania obrazowe (RTG klatki piersiowej, USG zatok). Dobór badań zależy od objawów, wieku pacjenta i rodzaju podejrzewanej alergii.