Szczepienia są jedną z najskuteczniejszych metod zapobiegania chorobom zakaźnym, jednak – jak każda interwencja medyczna – mogą powodować działania niepożądane. Najczęstsze powikłania to odczyny miejscowe (ból, zaczerwienienie, obrzęk w miejscu wkłucia), gorączka, złe samopoczucie, ból głowy, bóle mięśni i stawów. Rzadziej występują reakcje alergiczne (pokrzywka, obrzęk, duszność), drgawki gorączkowe, powiększenie węzłów chłonnych, wysypka, a bardzo rzadko – poważne powikłania neurologiczne (np. zapalenie mózgu, zespół Guillaina-Barrégo). Objawy zwykle pojawiają się w ciągu kilku godzin do kilku dni po szczepieniu i ustępują samoistnie. W przypadku utrzymujących się lub nasilających objawów, wysokiej gorączki, duszności, drgawek lub zaburzeń świadomości należy niezwłocznie skontaktować się z lekarzem. Zgłaszanie powikłań pozwala na monitorowanie bezpieczeństwa szczepień i szybkie reagowanie na ewentualne zagrożenia.
