Zabieg chirurgiczny przy owrzodzeniu żołądka jest wskazany w przypadkach powikłanych wrzodów – perforacji, masywnego krwawienia, zwężenia odźwiernika lub podejrzenia nowotworu. Najczęściej wykonuje się resekcję części żołądka (antrektomię, wagotomię) lub zszycie perforacji. Zabieg przeprowadza się w znieczuleniu ogólnym, a jego zakres zależy od lokalizacji i rozległości owrzodzenia. W przypadku krwawienia chirurg lokalizuje źródło krwotoku i zamyka naczynia, a przy perforacji – zamyka ubytek i oczyszcza jamę brzuszną z treści żołądkowej. Po operacji pacjent wymaga monitorowania, żywienia dożylnego i stopniowego wprowadzania diety doustnej. Powikłania pooperacyjne to m.in. zakażenia, przetoki, zwężenia, niedobory pokarmowe. Współczesna chirurgia coraz częściej wykorzystuje techniki laparoskopowe, które skracają czas hospitalizacji i przyspieszają powrót do zdrowia. Kluczowa jest współpraca z gastroenterologiem oraz leczenie przyczyny wrzodu (np. eradykacja Helicobacter pylori).